Muzeum Świętego Jana Pawła II Wielkiego w Krakowie Białych Morzach od 1 marca 2020 roku działa pod kuratelą Centrum.

Misją Muzeum jest, m.in. zachowanie, upamiętnianie i propagowanie wiedzy o życiu Karola Wojtyły, o Jego pontyfikacie, intelektualnej spuściznie, która wpisuje się w dorobek kulturowy Polski i całego świata.

Nowoczesne w formie ekspozycje Muzeum, prezentujące wyjątkowe eksponaty, w tym dzieła sztuki, głównie tzw. „dary papieskie” są unikatowym, artystycznym świadectwem wiary, wdzięczności oraz twórczej inspiracji Osoby św. Jana Pawła II Wielkiego.

Muzeum to przestrzeń obcowania z historią, pięknem i kulturą – to miejsce promowania tych wartości we współczesnych pokoleniach.